A nagy kiállítási múlttal rendelkező Ernst Múzeum 2000-től a Dorottya Galériával egy intézményt alkot. Míg az Ernst Múzeum profilja a XX. század bemutatása, a Dorottya Galéria a kortárs művészet kiállítóhelye. Ma, állandó gyűjtemény nélkül, az Ernst Múzeum kétféle gondolatot ötvöz: egyrészt az "új művészettörténet" jegyében szervezett kiállításokkal új szempontok szerint kívánja bemutatni a modern magyar művészet és építészet eddig kevéssé értékelt vagy ismert, ám jeles életműveit, ágazatait, műfajait; másrészt a kiállításokat társművészeti és egyéb rendezvényekkel, illetve színvonalas katalógusokkal egészíti ki. Az Ernst Múzeum 2003 nyarától látogatóit egy új szolgáltatással is várja. Németh Lajos művészettörténész könyvtárának az Ernst Múzeumba kerülése folytán, ezt a XX. század művészetét a könyvek által gazdagon bemutató hagyatékot a múzeum látogatói szabadon forgathatják, olvashatják a kiállítások nyitvatartási ideje alatt.
