A templom számos értékes berendezése és felszerelése közül kiemelkedő jelentőségű a barokk kori szószék és sekrestye, valamint az 1761-ből származó fából faragott körbejárható rokokó öltözőszekrény. Baján a legrégebbi ismert barokk alkotás a templom külső déli falfülkéjében Máter Dolorosa 1740-ben készült szoboralakja.